GENOPATH-HD : Détection des agents pathogènes et caractérisation de biomarqueurs d’intérêt diagnostique ou épidémiologique en santé animale et sécurité sanitaire des aliments dans le cadre d’une approche ‘One Health’

Responsabilité scientifique :

Patrick FACH

Partenariat :

UMR BIPAR: INRAE-ENVA-ANSES

UMR VIRO: INRAE-ENVA-ANSES

DYNAMYC: UPEC

Financement :

Biomark HD (Fluidigm)

Descriptif :

Le développement de « PCR on chip » pour l’identification et la caractérisation des agents infectieux sera mis en œuvre dans de nombreux projets portés par l’Agence pour détecter des émergences à caractère zoonotique ‘de la fourche à la fourchette’, avec l’objectif de pouvoir être en mesure d’effectuer une comparaison fine de clones d’origine animale, alimentaire et humaine afin de mieux définir les notions de «souches épidémiques» et de «souches pathogènes», à risque pour l’homme et/ou l’animal. Les outils développés permettront l’identification et le typage (recherche de clone, caractère pathogène, antibiorésistance, etc) pouvant être construit selon une approche syndromique (pathologies respiratoires, neurologique, intestinales) ou par agents (par exemple E. coli pathogènes). La mise au point et la validation de nouvelles technologies nous permettra d’être en capacité de fournir, en cas d’urgence locale ou internationale, des méthodes innovantes pour détecter, caractériser rapidement et précisément les agents pathogènes infectieux avec également la possibilité de favoriser leur transfert à une échelle industrielle.

Les principaux objectifs du projet consistent après acquisition du Biomark HD à développer la mutualisation des techniques de « PCR on chip », très haut et moyen débit proposées par la plateforme IdentyPath de l’Anses afin de mieux assurer la réalisation de projets de recherche en santé animale et sécurité des aliments dans le cadre d’une véritable approche ‘One Health’.