Toward Single Cell Analysis of Proteome (SLIM)
Responsabilité scientifique :
MATONDO Mariette
Axes de recherche :
Partenariat :
Unité de Spectrométrie de Masse pour la Biologie(MSBio), CNRS UAR2024
La récente pandémie de COVID 19, qui touche le monde depuis trois ans, nous enseigne l’urgence de développer de nouveaux outils pour l’identification et la caractérisation des agents pathogènes dans les situations d’épidémies ou de maladies d’origine inconnue. Ces infections sont souvent étudiées au niveau de populations hétérogènes d’agents pathogènes ou de cellules infectées. La compréhension des mécanismes moléculaires qui sous-tendent la contribution des cellules individuelles et des pathogènes au coursdes interactions hôte-pathogène peut contribuer à la conception et au développement de nouvelles stratégies thérapeutiques pour lutter contre les maladies infectieuses. Le protéome est l’ensemble des protéines exprimées par une cellule, un tissu ou un organisme à un moment donné. Ces dernières années, des avancées technologiques impressionnantes ont été réalisées en protéomique basée sur la spectrométrie de masse, permettant aujourd’hui, comme pour la génomique et la transcriptomique, de réaliser des études protéomiques de la cellule uniqueà haut débit et haute sensibilité. Profitant de ces avancées technologiques, l’unité de Spectrométrie de Masse pour la Biologiede l’Institut Pasteur (MSBio) propose de mettre en place pour la première fois au sein de sa plateformeprotéomique en Ile-de-France l’analyse de la cellule unique pour les maladies infectieuses. La plateformebénéficie d’un environnement scientifique et technologique très favorable. Avec les huit partenaires scientifiques de SLIM, reconnus dans le domaine des maladies infectieuses, nous proposons de travailler sur différents pathogènes et infections afin de couvrir un large spectre de modèles. Enfin, nous collaborons avec de nombreux laboratoires en France et en Europe et participons à de nombreux consortiums en Ile-de-France (PPIF), en France (ProFI) et en Europe (C4L, EPIC-XS-H2020).